クラミジアの検査方法について（男性）

生理が終わったばかりなのに、なんとなく、おりものの多い感じと性交時の違和感があり、婦人科にいったところ、クラミジアの感染を起こしていました。
性交渉は同棲中の彼氏としかしていないのですが、彼氏は身に覚えがないといいます。
検査の方法は泌尿器科で尿検査をしてきてなんともなかったと検査結果を持ってきました。女性との検査方法に違いがあるみたいなのですが、結果って一回できちんとわかるものなのでしょうか。
正直疑っています。

泌尿器科泌尿器・男性生殖器（前立腺・精巣・陰茎）前立腺炎精巣上体炎